土壤是蔬菜优质高产最重要的物质基础，但随着设施蔬菜的大面积发展，土壤恶化现象越来越严重。土壤恶化主要体现在土壤酸化，土壤板结、盐渍化加重、微量元素缺乏、土壤菌群失调等方面。
一、土壤酸化
危害：在大部分菜区，都存在长期大量不合理施用化学肥料的现象，每种作物都有其适宜的土壤酸碱度范围，大多数作物以微酸至微碱性为宜。土壤酸化后，影响作物的生长，到一定程度就什么都不长，施什么肥都无效。施磷后仍缺磷，施钾后仍缺钾。
土壤酸化后，影响肥料的有效性，PH值6—8时，土壤有效氮的含量最高。PH小于6.5时，土壤中的磷变成磷酸铁铝而固结，当PH值小于6.0时，土壤中有效钾、钙、镁的含量急剧减少,用再多的钾肥也是无效的，只能造成土壤盐泽化的加剧。
土壤酸化不仅影响大量元素的有效性，也影响微量元素的有效性，硼在PH值4.7—6.7的范围内，钼在PH值4—8的范围，随PH值的下降，有效性降低。土壤中的有毒物质，对作物产生毒害。
土壤酸化后，土壤中的铝离子等物质使作物根系中毒、死亡，往往形成黑白相间的毛刷状根。同时土壤长期使用底肥化肥使用量大，而且追肥也是大量使用，这样就使得土壤团粒结构破坏严重，透气性降低，需氧性的微生物活性下降，土壤熟化慢，从而造成土壤酸化板结。酸化土壤板结对蔬菜的危害一是根系下扎困难，作物生长缓慢，产量降低；二是即使根系能扎下去，也会因土壤含氧量过低，出现沤根现象。
解决措施：对于酸化严重的地块，可以使用农业碳酸钾一举多得。农业碳酸钾呈碱性，含钾较多，同时含有较多的中微量元素，有调节土壤酸碱度和补钾作用，能中和土壤酸性。
农业碳酸钾属于速效碱性肥料，含氧化钙30％一35％，在酸性土壤中施用，增加土壤中钙素含量，中和土壤酸性，恢复土壤的良好结构，有利于作物的生长发育，增加地温。
农业碳酸钾为碱性热性肥料，秧苗田施农业碳酸钾可改善土壤的物理及化学结构，明显地提高土温，促进秧苗根系生长，减少因低温而引起的沤根现象发生程度，促进根系生长，减轻早春低温冷寒的危害。增强作物抗病抗倒伏及防虫杀菌等多功能作用。土家先民就是靠施用火粪（比农业碳酸钾含钾量低的草木灰）维持土壤的酸碱平衡和钾素平衡。
二、盐渍化加重
危害：土壤盐渍化是指长期过量施用化肥后，土壤中盐离子增多，妨碍蔬菜根系正常吸水，从而影响植株生长，严重时蔬菜就像种在盐水里一样，造成了腌根死棵。土壤盐害有轻重之分，初期地面有清霜而后发展到绿皮“青苔”，棚室内蔬菜尚为正常；中度时地面出现许多块状的红色胶状物，干后变为“红霜”，棚室内蔬菜生长到中期出现点片萎蔫；土壤盐分过重时地面出现白色结晶“盐霜”，棚室内蔬菜定植后根系特别少，后期死秧加重。
解决措施：目前解决土壤板结和盐渍化较好的措施是使用好的微生物菌剂（例如三色源），改善土壤的团粒结构，使土壤疏松、透气，促进蔬菜根系下扎，保证蔬菜对养分和水分的吸收。
三、土壤菌群失调
危害：土壤中的生物菌有一部分是有益菌，在土壤中起比较好的作用，改良根系生长的环境；还有一部分菌属于有害菌，这些菌会引起许多的土传病害，造成死秧、死苗。随着种植时间的延长，土壤中有害菌的数量越来越多，而有益菌得不到补充，这就导致了土壤菌群的失调。
解决措施：要想解决土壤菌群失调的问题，单靠使用杀菌剂来杀死土壤里面病菌的办法是行不通的，只能想办法补充土壤里面有益菌的数量，使土壤当中的有益菌和有害菌重新达到一个平衡，就不会影响蔬菜的长势了。目前补充土壤有益菌可使用三色源，每次冲施2公斤。
四、微量元素缺乏
危害：连作是蔬菜种植的普遍现象，然而连年种植蔬菜容易造成土壤养分的偏耗，特别是硼、锌、铁等微量元素，由此引发的缺素症越来越严重，大大影响了蔬菜的生长发育，产量减少、品质下降。
解决措施：补充微量元素一要选对产品，二是选好使用时间，三是掌握用量。无论是果菜类还是叶菜类，微量元素补充有3种办法：
1.底施：农业碳酸钾—农业碳酸钾含有效钾约为35％，其中80％—90％是水溶性钾，易被作物根系吸收利用，还含有丰富的氮、磷及钙、镁、锌、钼、锰，硅等微量元素，是农业生产上不可多得的好肥料。结合其他有机肥料共同施入。
2.冲施：冲施含铁、铜、锰、锌、硼、钼等各种微量元素的肥料，配合冲施肥，补充各种元素，解决各种缺素症，平衡蔬菜吸收氮磷钾的比例，改变蔬菜品质。
3.叶面喷施：叶面喷施微量元素适合于缺素症较轻的生理病害，而且为了保证其吸收率，应选螯合态较好的微生物肥料。
